DNA甲基化
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易基因-Chip-seq(组蛋白)植物育种典型论文
易基因:ChIP+RNA-seq技术揭示NURR1在前列腺癌从基因转录到肿瘤进展中的调控机制:CDD
前列腺癌(prostatecancer,PCa)是一种常见的恶性肿瘤,其进展过程中常常伴随着癌症干细胞特性的增强、上皮-间充质转化(EMT)现象的发生以及对传统治疗的抵抗。Wnt/β-catenin信
ChIP-seq等揭示植物H3K27me3相关转座元件沉默模式及与DNA甲基化动态转换
转座元件(transposable elements,TEs)是基因组中能够移动和复制的重复序列,其活动通常对宿主生物有害,因此被宿主严格调控。然而,TEs的活动在进化中也扮演了重要角色,例如通过为附
易基因:朱健康/郎曌博/牛庆丰团队ChIP-seq+WGBS揭示番茄果实成熟中DNA甲基化与转录因子
果实成熟是一个高度协调的过程,涉及多种生理和生化变化,如软化、着色和香气合成。这一过程受到植物激素和转录因子的调控。番茄作为研究果实发育和成熟的模式植物,其成熟过程伴随着乙烯的产生和信号通路。已知多个
RNA-BS揭示NONO蛋白通过调控PTEN mRNA的m5C修饰和可变剪切促进胃癌进展
RNA修饰如N6-甲基腺苷(m6A)和5-甲基胞嘧啶(m5C)在基因调控中发挥重要作用。m5C修饰不仅存在于核糖体RNA和转运RNA中,也在信使RNA(mRNA)中被检测到,主要通过NSUN2催化,影
WGBS揭示AtSAMS通过DNA甲基化和乙烯信号通路协同调控植物花器官发育的表观遗传机制
花器官是植物繁殖的关键结构,其发育受到严格的遗传调控。ABC模型是解释花器官发育的经典理论,其中A、B、C、E功能基因分别调控萼片、花瓣、雄蕊和雌蕊的形成。然而,这些基因的表达调控机制尚未完全明确。D
易基因:RRBS及EWAS分析揭示同卵双生子与肾小球滤过率相关的DNA甲基化位点|疾病研究
慢性肾脏病(Chronic kidney disease,CKD)以肾功能持续下降为特征,其主要评估指标为估算肾小球滤过率(eGFR)。eGFR的下降不仅预示着CKD的发生,还与心血管疾病风险密切相关
易基因:宏基因组学揭示猪粪与土壤中抗菌药物抗性基因与金属抗性基因的共存及共选择机制|项目文章
抗菌药物被广泛用于治疗人类和动物的感染性疾病,但其过度使用导致了抗菌药物抗性(AMR)增加。细菌对几乎所有类别的抗菌药物都已表现出抗性,这引起了全球关注。抗菌药物抗性对公共健康构成全球性挑战,而动物饲
易基因:WGBS+ChIP-seq技术揭示Cdx2转录因子在发育与稳态中的动态结合机制
Cdx2是一个关键的转录因子,在小鼠肠道上皮细胞的发育过程中起着决定性的作用。它在胚胎期和成年期的肠道上皮细胞中都有表达,但其结合的基因组位点在发育和成年期有所不同。DNA甲基化是一种表观遗传修饰,通
易基因:DNA甲基化研究思路与项目设计:下游实验设计
中农大曾祥芳团队WGBS+ChIP-seq揭示蛋氨酸在母胎免疫耐受和子宫内膜容受中的表观调控机制
母胎免疫耐受是指母体免疫系统对胎儿抗原的耐受,避免对胎儿产生免疫排斥反应。子宫内膜容受性是指子宫内膜接受胚胎着床的能力。子宫内膜容受性和母胎免疫耐受是成功妊娠的两个关键过程。然而,营养所涉及的分子机制
ChIP-seq等揭示桃树需冷量和芽休眠调控的关键基因
桃树(Prunus persica)等多年生果树的芽休眠是其冬季生存的关键策略,需冷量(chilling requirement,CR)是打破休眠的必要条件之一。然而,全球变暖导致许多地区的需冷量难以
特异性R-loop检测整体研究方案
01.技术简述R-loop是由DNA:RNA 杂交体和被置换的单链DNA组成的三链核酸结构,广泛参与基因转录、表观遗传调控及DNA修复等关键生物学过程。异常的R-loop积累会导致基因组不稳定性,与癌
易基因:m6A-seq揭示KRAS突变通过调控ALKBH5翻译后修饰导致肺癌对铂类药物耐药
KRAS基因突变在非小细胞肺癌(NSCLC)中非常常见,尤其是KRAS G12C、G12V、G12D等突变类型。这些突变通常导致KRAS蛋白处于持续激活状态,促进肿瘤发生和发展。然而,KRAS突变与铂
cfWGBS揭示与年龄和肌萎缩侧索硬化相关cfDNA甲基化变化及组织/细胞溯源
游离细胞DNA (Cell-free DNA,cfDNA)是血浆中游离的DNA片段,通常来源于正常细胞更新或病理状态下的细胞死亡。cfDNA已被广泛应用于癌症早期检测、胎儿遗传病诊断、器官移植评估等领
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